Harvard’daki Wyss Enstitüsü, Boston Children’s Hospital ve Harvard Medical School araştırmacıları, ilaç keşfi için DNA tabanlı bir tarama platformu geliştirdi. Science’ta 5 Kasım’da yayımlanan FIND çalışması, moleküllerin yalnızca hedef proteine bağlanıp bağlanmadığını ölçmek yerine proteinlerin birlikte çalışma biçimini değiştirip değiştirmediklerine bakıyor.
Sistemde uzun DNA şeritleri, hedef proteinleri ve aday molekülleri taşıyan birer deney düzeneğine dönüşüyor. Bir aday iki proteinin etkileşimini güçlendirdiğinde DNA üzerinde bir halka oluşuyor. Halkalı ve doğrusal yapılar jel elektroforeziyle ayrılıyor; adayların kimlikleri de taşıdıkları DNA barkodları okunarak belirleniyor.
400 milyon üyeli kütüphaneden başlayan tarama
Ekip, metabolizmanın düzenlenmesinde rol oynayan PPAR-gama reseptörü için 400 milyon üyeli bir molekül kütüphanesinden başlayan tarama gerçekleştirdi. Seçilen bazı moleküller, reseptörün ortak bir protein parçasıyla etkileşimini artırdı. Hücre kültüründeki deneyler de reseptörün etkinleşmesiyle uyumlu sonuçlar verdi.
Araştırmacılar ayrıca SARS-CoV-2’nin başak proteiniyle insan hücresindeki reseptörü arasındaki etkileşimi değiştiren bir nanokor buldu. Bu örnek, yöntemin araştırma araçları geliştirmekte de kullanılabileceğini gösteriyor.
Bulgular yeni bir tedavinin hazır olduğu anlamına gelmiyor. Seçilen moleküllerin güvenliği ve insanlarda işe yarayıp yaramadığı ayrı çalışmalarla belirlenmeli.